返回参赛队伍队伍名称PerturbCell 造物者小队PerturbCell多药扰动预测融合多模态信息与基因调控网络,预测药物条件下细胞转录组响应天津大学网络安全学院T5 虚拟细胞 项目名称PerturbCell多药扰动预测T5 虚拟细胞多药扰动预测扰动对照评估把处理前后的差异拆开看,才发现模型很可能只是把原来的细胞背景复制了一遍 —— 并没有真正学会药物响应。天津大学 PerturbCell 造物者小队把这次「高分幻觉」当成了转折点:重做评估、增加诊断、加入错误条件对照。队伍名称PerturbCell 造物者小队所属院校天津大学网络安全学院参赛队伍相关影像仅用于赛事展示与报道,肖像权归本人所有。如对肖像使用存在异议,请通过 联系我们 向组委会反馈,我们将核实情况并作相应处理。展开更多项目内容队伍口号“让扰动可预测,让细胞可计算 ”项目背景为什么要在电脑里做扰动实验生命系统精准预测,是合成生物学走向理性设计的核心瓶颈。具体到药物扰动:传统湿实验依赖低通量试错,周期长、成本高,难以系统解析单药及多药联合扰动下细胞状态的复杂响应。「多药联合」这四个字是难度的来源。单药的组合数是线性的,两两组合就是平方,再加上剂量、细胞类型,空间大到不可能穷举。这个问题让湿实验面临两个挑战 —— 搜索空间太大,真实的生物系统又太复杂。AI 可以从大规模单细胞数据和药物的结构、靶点、机制等信息中学习规律,快速提出优先验证的预测;细胞实验则负责检验这些预测、发现模型的盲区。AI 用于提高候选筛选效率,实验用于验证预测结果。项目过程项目推进与验证路径01阶段 1那个接近满分的分数团队曾得到接近满分的总体相关性,但把处理前后的差异单独评估后发现,模型可能主要复制了原有细胞背景,没有学会药物响应。团队因此重做评估、增加诊断,并加入错误条件对照。02阶段 2评估不只看总体相关性不只看总体相关性,还检查差异表达的方向、关键基因的命中率,以及打乱或移除药物信息之后的表现变化。四项里有三项是专门针对上面那个陷阱设计的 —— 方向对不对、关键基因抓没抓到、把药物信息拿掉之后分数会不会掉。如果拿掉药物信息分数几乎不掉,那就说明模型压根没在用它。Learn 阶段则是根据「幅度低估」或「方向错误」这类失败模式来调整模型 —— 不是笼统地「再训一版」,而是对着具体的失败类型改。03阶段 3先冻结测试集数据规模大,不同数据体系差异明显,单次划分和单个随机种子都可能误导结论。项目证据项目图表与方法记录多模态扰动模型结构结构图展示单细胞表达、药物结构与文本知识进入模型后生成扰动响应预测的路径。训练任务运行日志终端记录模型训练与评估任务,便于复核数据版本、参数和运行结果。扰动验证设备与耗材实验台上的设备、移液器与耗材用于细胞样品处理和标准化验证。团队协作计算、实验与候选复核记录模型版本多指标对照表格按 MSE、差异表达相关性和 Top-K 命中等指标比较多个模型版本,不同指标对应的最优版本并不相同。项目简介示意图多模态输入(单细胞转录组、药物结构与文本知识)汇入模型,输出单药与多药扰动下的转录响应预测。细胞实验准备区超净工作台内的耗材与样品位置,记录后续关键药物扰动验证的实验准备。基线模型评估表屏幕列出多种基线模型及指标结果,用于比较不同方法在扰动预测任务中的表现。实验结果记录表文档按实验版本整理运行设置与评价结果,为模型复核保留可追溯记录。队伍影像 06:12
项目名称PerturbCell多药扰动预测T5 虚拟细胞多药扰动预测扰动对照评估把处理前后的差异拆开看,才发现模型很可能只是把原来的细胞背景复制了一遍 —— 并没有真正学会药物响应。天津大学 PerturbCell 造物者小队把这次「高分幻觉」当成了转折点:重做评估、增加诊断、加入错误条件对照。队伍名称PerturbCell 造物者小队所属院校天津大学网络安全学院