返回参赛队伍队伍名称灵犀酶算APEH木聚糖酶 AI 辅助设计输入待改造木聚糖酶的 PDB 与改造目标,输出可供湿实验验证的候选突变体与分析报告华南理工大学生物科学与工程学院T3 生物制造 项目名称APEH木聚糖酶 AI 辅助设计T3 生物制造木聚糖酶改造突变体湿实验华南理工大学「灵犀酶算」做的 APEH 是一个能用的东西:用户上传待改造木聚糖酶的 PDB 结构文件、设定改造目标,系统自动完成结构解析、候选突变生成、干实验模拟评分与排序,最后输出候选突变体的结构文件与综合分析报告。队伍名称灵犀酶算所属院校华南理工大学生物科学与工程学院参赛队伍相关影像仅用于赛事展示与报道,肖像权归本人所有。如对肖像使用存在异议,请通过 联系我们 向组委会反馈,我们将核实情况并作相应处理。展开更多项目内容项目背景面向木聚糖酶的专用改造流程该流程用于在湿实验前生成、筛选和排序木聚糖酶改造方案,目标是缩小实验候选范围。后续应以实际实验命中率、时间和材料消耗与基线流程对比,才能判断是否提高成功率或降低成本。研究路径一条写死的工作流队伍把整条流程列成了一串,中间用破折号连着: PDB 输入 → 结构解析 → 候选突变生成 → 结构预测 → 干实验评分 → Top-N 推荐 → 湿实验验证 七个环节,环环相扣。用户那一侧只需要做两件事:上传 PDB 文件,设定改造目标。剩下的由系统自动完成。最终交付两样东西:候选突变体的结构文件,和一份综合分析报告。交结构文件而不只是序列,是个有意思的选择 —— 它意味着下游的人可以直接拿去看构象、算对接、或者继续做别的计算,而不用自己再折一遍。设计平台APEHAPEH 面向木聚糖酶改造任务组织候选生成、筛选与排序。输入与目标PDB + 改造目标用户输入蛋白结构文件并指定耐热、耐碱或比活力等改造目标。验证路径干实验评分 + 湿实验候选经结构预测与干实验评分形成 Top-N 清单,再进入突变体湿实验验证。项目过程项目推进与验证路径01阶段 1预期产出里,还有一份安全审批材料团队把原型工具链、候选结构文件、干实验评分、湿实验数据、项目 Wiki、技术方案书和安全审批材料列为预期产出。Wiki 用于记录使用方式,安全审批材料用于后续实验合规。02阶段 2平台的终点在实验台上工作流的最后一环写的是「湿实验验证」,而不是「输出推荐」。项目证据项目图表与方法记录候选突变计算检查成员在工作站核对模型代码和候选输出,为下一步排序检查输入数据与运行参数。候选样品处理队员处理已标记的实验样品,为候选突变体的后续酶活检测做准备。实验体系配液队员使用分析天平称量试剂,按统一条件配置候选突变体表达与活性测定所需体系。APEH 干湿闭环左侧完成结构解析、候选生成与评分排序,右侧负责构建、表达和活性测定;候选清单与实测数据在两端往返。团队协作计算、实验与候选复核记录干湿实验方案对齐四名成员围绕电脑和记录讨论候选排序,把计算端输出与实验安排逐项对应。候选样品分装队员按编号处理样品,准备比较不同候选突变体在统一条件下的实验表现。样品离心处理离心设备用于分离候选样品,为后续检测准备条件一致的实验材料。
项目名称APEH木聚糖酶 AI 辅助设计T3 生物制造木聚糖酶改造突变体湿实验华南理工大学「灵犀酶算」做的 APEH 是一个能用的东西:用户上传待改造木聚糖酶的 PDB 结构文件、设定改造目标,系统自动完成结构解析、候选突变生成、干实验模拟评分与排序,最后输出候选突变体的结构文件与综合分析报告。队伍名称灵犀酶算所属院校华南理工大学生物科学与工程学院